Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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