Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPTFQ12830 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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