Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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