Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms