Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms