Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms