Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms