Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms