Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN1Q04323 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms