Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ZRANB2-AS2-205ENST00000455406 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AL392023.2-201ENST00000554687 785 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms