Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLH2Q02577 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLH2Q02577 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NHLH2Q02577 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms