Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APBA1Q02410 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms