Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRG1Q02297 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms