Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms