Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms