Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms