Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms