Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HPCAP84074 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPCAP84074 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPCAP84074 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms