Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms