Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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