Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK4P57078 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms