Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF1P55201 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms