Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms