Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DAP3P51398 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DAP3P51398 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms