Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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