Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPHP49418 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPHP49418 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPHP49418 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPHP49418 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMPHP49418 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMPHP49418 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMPHP49418 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPHP49418 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPHP49418 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPHP49418 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPHP49418 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPHP49418 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPHP49418 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms