Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms