Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A3P48751 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms