Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCP4P48539 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PCP4P48539 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms