Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCAMP43121 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms