Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL1P40616 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL1P40616 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL1P40616 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL1P40616 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL1P40616 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL1P40616 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL1P40616 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL1P40616 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL1P40616 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms