Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms