Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LTBRP36941 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms