Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms