Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms