Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKBRP32239 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKBRP32239 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms