Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKARP32238 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms