Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC13P31276 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms