Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms