Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA10P31260 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms