Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms