Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA1P29973 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms