Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms