Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB5P28074 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB5P28074 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB5P28074 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB5P28074 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB5P28074 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB5P28074 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms