Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms