Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKBIAP25963 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms