Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms