Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCL3P20749 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCL3P20749 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCL3P20749 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms