Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms