Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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PTPRAP18433 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRAP18433 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRAP18433 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRAP18433 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRAP18433 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRAP18433 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRAP18433 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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